Pertempuran Sengit! Medan Perang Para Gadis 3 ～Operasi Serangan Kilat! Hasil Perang

Ini adalah kisah yang terjadi sekitar setengah abad setelah Perang Dunia Kedua yang berbeda dari sejarah nyata.
Setelah perang dunia, sebuah negara yang untuk sementara memimpin dunia sebagai pusat negara-negara pemenang mengalami kegagalan eksperimen ilmiah besar yang menyebabkan ledakan besar, dan hampir seluruh wilayah negaranya berubah menjadi tanah hangus.
Karena kehancuran negara itu, keseimbangan militer dunia yang selama ini bertahan menjadi tidak seimbang, dan berbagai negara memicu perang baru demi hegemoni dunia.
Dalam perang besar ini, Republik Federasi Jepang, Kerajaan Howell, dan Kekaisaran Schwarzwald menjadi tiga pemenang terakhir, sementara beberapa negara lain diserap oleh berbagai faksi, dan ada pula negara yang memilih netral untuk menjauh dari medan perang. Situasi dunia pun berubah sepenuhnya.
Setelah itu, tiga negara besar yang baru saja kelelahan akibat perang panjang, agar tidak mengulangi kesalahan yang sama, untuk sementara menghentikan pertikaian, dan dunia pun memasuki keadaan Perang Dingin.
Namun, menghadapi dunia yang bertahan dengan keseimbangan rapuh seperti es tipis dan bisa runtuh kapan saja, setiap negara tidak berani lengah dalam wajib militer dan pengembangan persenjataan, terus melakukan perlombaan senjata untuk menghadapi perang baru.
Setelah itu, lahirlah sebuah hasil penelitian baru di dunia, yaitu teknologi inovatif berkode "IOS" yang dijalankan melalui sistem operasi senjata serbaguna bernama "Interoperate System".
Jika perangkat yang menyederhanakan proses yang diperlukan untuk menggunakan senjata ini, sehingga bahkan orang tanpa pengetahuan khusus dapat mengoperasikan senjata apa pun sesuka hati, benar-benar diterapkan, waktu yang dihabiskan untuk pelatihan operasi serta jumlah minimum personel yang dibutuhkan untuk menggunakan senjata akan berkurang drastis, dan akan lahir pejuang serba bisa pamungkas yang mampu menguasai semua senjata darat, laut, dan udara.
Namun, IOS memiliki batasan bahwa hanya orang yang cocok yang dapat menggunakannya.
Kisah ini dimulai dari hari-hari sang protagonis, yang tergabung dalam pasukan militer reguler 『Republik Federasi Jepang』 dan memiliki kecocokan dengan IOS, dalam menyelesaikan misi-misinya.